يقدم معهد الشيخ دروسًا في التربية الإسلامية للأطفال بهدف تعليمهم القيم والأخلاق الإسلامية وتطوير شخصياتهم وسلوكهم الديني. تتضمن هذه الدروس تعليم الأذكار اليومية والدعاء، وتعليم الأخلاق والقيم الإسلامية، وتعريف الأطفال بالحج والصيام والصلاة وغيرها من العبادات الإسلامية. وتعتمد الدروس على مناهج حديثة ومتطورة تحتوي على نشاطات وأنشطة تعليمية تفاعلية ومسلية لتجذب انتباه الأطفال وتسهم في تحفيزهم على التعلم والاستمرار فيه. كما تتميز الدروس بالتنوع والانسجام مع مستوى وعمر الأطفال، حيث تتضمن محتويات وأساليب تعليمية تناسب الفئة العمرية المستهدفة.